長いタイトルですが、非常にストレスだったので記事にしました。
かな入力でATOKを使っているWindows環境で、Slackや新しいSkype(8.0以降)など、Electron系のアプリケーションに日本語を入力すると、突然全角英字入力に切り替わってしまう場合があります。

ATOKの設定を変更することで簡単に対処が可能です。

タスクトレイのATOKメニューを右クリックして、「ATOKメニュー」→「プロパティ(環境設定)」を開きます。

左のメニューから「入力補助」を選択します。

中央あたりの「詳細設定」を選択します。

「ATOKの内部状態を優先する」にチェックを入れます。

すべてのダイアログを「OK」で閉じます。

Electronのアプリケーションを一度閉じ、再起動すると設定が反映されます。